南京东南眼科医院综合眼病诊疗中心，是集眼科临床医疗、科研及预防保健于一体的医院核心科室。拥有多名专家，对眼表疾病、角膜病、眼外伤、眼眶疾病及各类眼病的诊治及预防保健，具有丰富的临床经验，并将当前眼科领域较新、较前沿的诊治方法用于临床。
综合眼病诊疗中心主要开展各种眼表疾病、眼底疾病的诊治新技术，包括微创玻切技术、青光眼小梁切除术、黄斑部疾病、各种视网膜脱离、糖尿病眼病、高度近视眼底病变、早产儿视网膜病变、先天性白内障等疑难眼病的诊治。